Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops5O35864 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops5O35864 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops5O35864 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops5O35864 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops5O35864 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops5O35864 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cops5O35864 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Cops5O35864 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cops5O35864 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cops5O35864 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cops5O35864 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cops5O35864 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cops5O35864 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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