Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccrl2O35457 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccrl2O35457 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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