Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Slc18a3O35304 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc18a3O35304 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms