Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ArxO35085 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ArxO35085 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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ArxO35085 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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ArxO35085 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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ArxO35085 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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ArxO35085 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ArxO35085 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ArxO35085 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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