Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EllO08856 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
EllO08856 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
EllO08856 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
EllO08856 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EllO08856 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms