Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms