Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm21310J3QQ23 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms