Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3727J3QM54 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3727J3QM54 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3727J3QM54 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3727J3QM54 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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