Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
2610021A01RikE9Q0Q3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms