Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ccdc175E9PVB3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc175E9PVB3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms