Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim30cD3YVI9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms