Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6133B2RY53 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms