Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brpf3B2KF05 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms