Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
1700042G07RikB1AUF7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms