Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms