Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prr16A3KMN5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Prr16A3KMN5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prr16A3KMN5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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