Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Cldn6Q9Z262 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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