Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms