Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cry2Q9R194 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms