Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms