Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms