Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Limd1Q9QXD8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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