Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tlr5Q9JLF7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms