Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Upk3aQ9JKX8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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