Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms