Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hipk3Q9ERH7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hipk3Q9ERH7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms