Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn12Q9ER56 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn12Q9ER56 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms