Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tlr6Q9EPW9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tlr6Q9EPW9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms