Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Xab2Q9DCD2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Xab2Q9DCD2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Xab2Q9DCD2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Xab2Q9DCD2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Xab2Q9DCD2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Xab2Q9DCD2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Xab2Q9DCD2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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