Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc89Q9DA73 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc89Q9DA73 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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