Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot8Q9D8X5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cnot8Q9D8X5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cnot8Q9D8X5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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