Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sdr42e1Q9D665 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr42e1Q9D665 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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