Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec23bQ9D662 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms