Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx29Q9D3S3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms