Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lmbr1lQ9D1E5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms