Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Acsl3Q9CZW4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Acsl3Q9CZW4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms