Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RpainQ9CWY9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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