Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930519P11RikQ9CUJ8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
4930519P11RikQ9CUJ8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms