Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Polr3kQ9CQZ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms