Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ykt6Q9CQW1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms