Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim8Q9CQQ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms