Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nudt21Q9CQF3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms