Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Chmp1b1Q99LU0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms