Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smim11aQ99J19 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim11aQ99J19 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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