Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms