Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atl3Q91YH5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms