Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp3Q91W36 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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