Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln1Q8R317 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ubqln1Q8R317 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubqln1Q8R317 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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