Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fcho1Q8K285 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Fcho1Q8K285 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms