Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek9Q8K1R7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms